Dvousvazková Mařatkova gastroenterologie je koncipována jako profilová učebnice gastroenterologie a hepatologie. Jde o původní a komplexní učebnici encyklopedicky pokrývající veškerou oborovou problematiku. Cílem autorů bylo navázat na jedinečnou Mařatkovu Praktickou gastroenterologii. Obor se však od jejího vydání v roce 1964 dramaticky změnil, což se samozřejmě promítlo do koncepce a obsahu předkládané publikace, která reflektuje:
• jasnější pochopení základních mechanismů onemocnění na buněčné, genetické a molekulární úrovni;
• jasnější porozumění patofyziologii gastrointestinálních nemocí a onemocnění jater;
• zavedení četných diagnostických testů a postupů, z nichž mnohé nahradily klasické metody;
• kombinace diagnostické a terapeutické endoskopie;
• farmakologický vývoj nových léků na stavy, které dříve nebylo možné farmakologicky léčit.

Nové kapitoly zahrnují aktuální diskusi o střevním mikrobiomu, probiotikách a fekální transplantaci mikrobiomu, o imunologii a nových poznatcích molekulární genetiky v gastroenterologii. Některé kapitoly mají výrazný mezioborový přesah - zabývají se nemocemi, které jsou velkou výzvou pro diagnostiku a léčbu v klinické praxi. Výrazným rysem monografie je přehlednost, detailní tabulky a vysoká kvalita obrazové dokumentace.
Součástí knihy je její elektronická verze, která obsahuje:
• kompletní text Mařatkovy gastroenterologie obohacený o interaktivní prvky s možností vyhledávání;
• nástroje pro psaní poznámek, podtrhávání textu a pořizování výpisků;
• videa prezentující diagnostické metody a operační výkony;
• testové otázky, které prověří znalost přečtené kapitoly;
• rozšířené seznamy literatury k jednotlivým kapitolám.