Budoucnost proměnila New York v technologicky vyspělé bitevní pole, ovládané klanem Noha a jeho kybervojáky. Sem přichází Michelangelo – poslední z želv ninja, aby se pomstil. Z jeho nejbližších zůstaly už jen vzpomínky, a tak mu nezbývá, než najít staré přátele, nové spojence a i za cenu vlastního života získat zpět síť kanálů pod městem. Legendární tvůrci Želv ninja, Kevin Eastman a Peter Laird přinášejí ve spolupráci se scenáristou Tomem Waltzem a výtvarníky Esauem a Isaacem Escorzovými a Benem Bishopem příběh, jenž na své zrození čekal dlouhých třicet let.